Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms