Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Serpina1cQ00896 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms