Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata5P97489 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms