Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms