Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms