Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GemP55041 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GemP55041 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GemP55041 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GemP55041 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms