Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolgP54099 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolgP54099 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PolgP54099 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PolgP54099 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PolgP54099 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PolgP54099 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PolgP54099 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolgP54099 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolgP54099 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolgP54099 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolgP54099 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolgP54099 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolgP54099 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolgP54099 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms