Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa8P50706 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms