Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox2P48432 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox2P48432 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox2P48432 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox2P48432 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms