Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc1P34928 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms