Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2aP34056 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2aP34056 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2aP34056 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms