Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcdP28867 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcdP28867 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms