Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atxn10P28658 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn10P28658 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms