Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms