Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xrcc5P27641 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc5P27641 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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