Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18530 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18530 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18530 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18530 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18530 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18530 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms