Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms