Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms