Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf1P15314 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Irf1P15314 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Irf1P15314 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Irf1P15314 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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