Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoa4P06728 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms