Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06320 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06320 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06320 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06320 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06320 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06320 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06320 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06320 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06320 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06320 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06320 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms