Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01669 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01669 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01669 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01669 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms