Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01667 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01667 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01667 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01667 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01667 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01667 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01667 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01667 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P01667 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01667 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01667 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01667 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01667 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01667 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01667 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01667 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01667 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01667 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms