Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffbO54788 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffbO54788 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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