Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Ptpn9O35239 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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