Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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