Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm3542K7N6U2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm3542K7N6U2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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