Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer2J3QPU5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms