Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc9a3G3X939 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc9a3G3X939 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms