Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp9yF8VPU6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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