Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms