Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms