Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myom3A2ABU4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myom3A2ABU4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms