Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN4Q9Y3Q4 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HCN4Q9Y3Q4 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315 ms