Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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SCN8AQ9UQD0 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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SCN8AQ9UQD0 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SCN8AQ9UQD0 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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