Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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CCDC88CQ9P219 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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CCDC88CQ9P219 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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CCDC88CQ9P219 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC88CQ9P219 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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