Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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SH3BP4Q9P0V3 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
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SH3BP4Q9P0V3 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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