Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C9orf78Q9NZ63 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C9orf78Q9NZ63 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf78Q9NZ63 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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