Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD3Q9NX63 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD3Q9NX63 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD3Q9NX63 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD3Q9NX63 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD3Q9NX63 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD3Q9NX63 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD3Q9NX63 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHCHD3Q9NX63 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CHCHD3Q9NX63 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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