Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
VGLL1Q99990 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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VGLL1Q99990 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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VGLL1Q99990 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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VGLL1Q99990 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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VGLL1Q99990 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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