Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms