Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRERF1Q96PN7 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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