Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCDC47Q96A33 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCDC47Q96A33 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCDC47Q96A33 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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