Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CHCHD4Q8N4Q1 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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