Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP49Q70CQ1 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP49Q70CQ1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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