Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED9Q6R2W3 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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ZBED9Q6R2W3 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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ZBED9Q6R2W3 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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