Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C4orf17Q53FE4 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
C4orf17Q53FE4 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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