Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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HIF1AQ16665 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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