Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
STX1AQ16623 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
STX1AQ16623 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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