Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKN1Q16512 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PKN1Q16512 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 344.7 ms